A história de Modern Warfare 3 começa onde o anterior título da série terminou (inclusão de breves cenas de Modern Warfare 2 estão perfeitamente inseridas na jogabilidade) .… permitam-me a deixa para desvendar apenas um segredo, Soap is alive! … com o Mundo num caos em que as tropas do ultranacionalista russo Makarov atacam tudo e todos, vemo-nos envolvidos em várias frentes, num cenário global, para tentar terminar com o conflito. A acção passa praticamente por todos os continentes e por algumas das maiores cidades americanas e europeias.